ในปี พ.ศ.2535 ครม.มีมติยุบ กรมแรงงานพร้อมกับจัดตั้งกรมพัฒนาฝีมือแรงงาน และกรมสวัสดิการและคุ้มครองแรงงาน ขึ้นในสังกัดกระทรวงมหาดไทย ต่อมาในปี 2536 ได้จัดตั้งกระทรวงแรงงาน และสวัสดิการสังคมโดยโอนกรมพัฒนาฝีมือแรงงานไปสังกัด กระทรวงแรงงาน และสวัสดิการสังคมในเดือนตุลาคม 2545 มีการปฏิรูประบบราชการ กรมพัฒนาฝีมือแรงงาน ยังคงอยู่กระทรวงเดิมภายใต้ชื่อที่เปลี่ยนจากกระทรวงแรงงานและสวัสดิการสังคม
เป็นกระทรวงแรงงาน ศูนย์พัฒนาฝีมือแรงงานจังหวัดกาญจนบุรี เป็นหน่วยงานราชการในสังกัด กระทรวงแรงงาน กรมพัฒนาฝีมือแรงงาน เริ่มดำเนินการฝึกอาชีพ ตั้งแต่ปลายปี พ.ศ.2538 จนถึงปัจจุบัน