สืบเนื่องจากความร่วมมือทางเศรษฐกิจ การพัฒนาด้านการค้า การลงทุน การท่องเที่ยว การพัฒนาทรัพยากรมนุษย์และสิ่งแวดล้อมในอนุภูมิภาคลุ่มน้ำโขง "The Greater Mekong Subregion(GMS)" ประกอบด้วย 6 ประเทศ คือ ประเทศจีน(มณฑลยูนนาน) พม่า ลาว เวียดนาม กัมพูชา และไทย
โดยคณะรัฐมนตรี ได้มีมติเมื่อวันที่ 27 สิงหาคม 2539 อนุมัติให้กระทรวงแรงงาน จัดตั้งสถาบันพัฒนาฝีมือแรงงานนานาชาติเชียงแสนขึ้น ณ อำเภอเชียงแสน จังหวัด เชียงราย เนื่องจากมีพื้นที่เหมาะสมและเป็นศูนย์กลางของอนุภูมิภาค นี้ด้วย พร้อมทั้งเป็นประตูหน้าด่านทางการค้าไปสู่ประเทศจีนตอนล่าง(มณฑลยูนนาน) สถาบันฯ ได้เริ่มดำเนินการก่อสร้างในปี พ.ศ. 2543 และก่อสร้าง แล้วเสร็จในปี พ.ศ. 2546 โดยใช้งบประมาณรัฐบาลในวงเงิน 144 ล้านบาท.