สำนักพิมพ์มูลนิธิโกมลคีมทอง เริ่มก่อตัวขึ้นพร้อมๆกับการก่อตั้งมูลนิธิ โกมลคีมทองในปี พ.ศ.2514 ซึ่งเป็นปีที่บัณฑิตหนุ่มนาม โกมล คีมทอง จากรั้วครุศาสตร์จุฬาฯ ผู้มีความใฝ่ฝันอันแรงกล้าที่จะทำโรงเรียนชุมชน ให้เกิดขึ้นจริงได้จบชีวิตลงที่จังหวัดสุราษฎร์ธานี

ด้วยแรงศรัทธาในคุณงามความดีและความกล้าหาญ ทางจริยธรรม ในการที่จะทำอุดมคติที่เป็นไปได้ยากให้เป็นไปได้นี้เอง บุคคลใกล้ชิดจึงร่วมกันจัดตั้งมูลนิธิฯขึ้นเพื่อทำหน้าที่กระตุ้น และส่งเสริมคนรุ่นหลังให้เป็นผู้นำในทางที่ถูกต้อง ตามแบบอย่างของครูโกมล